Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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