Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHROOM2Q13796 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms