Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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