Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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