Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DUSP4Q13115 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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