Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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TRAF1Q13077 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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TRAF1Q13077 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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TRAF1Q13077 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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