Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms