Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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