Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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