Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms