Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TMOD4Q9NZQ9 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TMOD4Q9NZQ9 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms