Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms