Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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VGLL1Q99990 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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