Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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ZBED3Q96IU2 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZBED3Q96IU2 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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