Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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