Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RPL26P34-201ENST00000431005 451 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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