Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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