Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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HIF1AQ16665 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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HIF1AQ16665 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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HIF1AQ16665 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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HIF1AQ16665 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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HIF1AQ16665 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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HIF1AQ16665 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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HIF1AQ16665 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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HIF1AQ16665 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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HIF1AQ16665 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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