Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms