Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCAQ16586 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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SGCAQ16586 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
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SGCAQ16586 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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SGCAQ16586 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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SGCAQ16586 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SGCAQ16586 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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SGCAQ16586 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SGCAQ16586 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SGCAQ16586 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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SGCAQ16586 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SGCAQ16586 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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SGCAQ16586 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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SGCAQ16586 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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