Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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SGCBQ16585 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SGCBQ16585 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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