Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms