Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHRNA6Q15825 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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