Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HMGN3Q15651 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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