Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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