Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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