Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CHD4Q14839 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CHD4Q14839 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CHD4Q14839 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CHD4Q14839 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CHD4Q14839 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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