Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms