Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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COL9A2Q14055 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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COL9A2Q14055 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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COL9A2Q14055 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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COL9A2Q14055 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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COL9A2Q14055 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
COL9A2Q14055 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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