Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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DDX39BQ13838 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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DDX39BQ13838 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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