Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CACNA1SQ13698 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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