Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms