Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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HDAC1Q13547 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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HDAC1Q13547 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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HDAC1Q13547 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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