Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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