Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms