Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms