Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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