Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATMQ13315 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATMQ13315 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
ATMQ13315 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
ATMQ13315 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.21
ATMQ13315 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
ATMQ13315 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATMQ13315 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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