Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms