Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms