Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms