Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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