Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms