Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TROQ12816 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TROQ12816 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TROQ12816 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TROQ12816 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TROQ12816 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TROQ12816 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms