Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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GTF3C1Q12789 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF3C1Q12789 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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