Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LRRTM2O43300 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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