Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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