Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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