Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms