Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRRTQ9BXP5 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRRTQ9BXP5 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms